Храм был построен в 1706 году. Это традиционное для Белозерья XVIII века здание типа восьмерик на четверике с двухпридельной трапезной, в которой помещались два предела в честь Воздвижения Креста Господня и преподобного Симеона Столпника. С 1916 года и до закрытия в храме служил священник Кирилл Дмитриевич Богословский.

В 30-е годы XX века храм разрушили. «Меня поразил рассказ А.Г.Лапина о том, как это происходило, – написал в своей книге К.Козлов. – Кресты сдёргивали под «Дубинушку» – канатом. Это считалось важным общественно-политическим мероприятием, и люди на него сгонялись со всего города. Много хлопот доставила разрушителям колокольня – динамита не было, техники тоже, и тогда додумались вот до чего: набили колокольню дровами и подожгли. Горела она несколько дней и «аутодофе» не выдержала – рухнула. Поистине – адское пламя!»

До 2000-х гг. в здании храма размещалось пожарная часть. Сейчас здесь располагаются магазины.

Источник: Утраченные памятники. Церковь Иоанна Богослова г. Белозерска./ Фонд "Наследие Русского Севера"