Правильное название церкви – Церковь Иоанна Крестителя, Лайксааре.

В 1896 году был основан самостоятельный приход Лайксааре, отделившийся от прихода Хяэдемеэсте. Число прихожан к этому времени достигло 1006 человек. Богослужения проводились в новом деревянном доме, снятом у хуторянина из деревни Урисааре, в котором открыли моленную. Первым приходским священником был назначен Д. Дубковский. Его приемником был Александр Пакляр, который с 1904 по 1935 год являлся попечителем эстонского прихода во имя Священномученика Исидора Юрьевского в Петербурге, где и был убит, став первой жертвой большевистских репрессий. В 1902 году приходу Лайксааре было выделено 25 гектар земли для устройства собственного кладбища. В 1911 году было построено деревянное здание, в котором расположились церковь и школа.

В 1918 году здание церкви сгорело в результате пожара. Новое здание из сосновых брёвен с башней и колокольней было построено в 1924 году и освящено митрополитом Александром в честь Иоанна Крестителя. Приход Сууре-Яани преподнёс в дар храму иконостас, который ранее находился в бывшей церкви из Олуствере. В 1927 году здание церкви было обито досками и окрашено. В 1939 году количество прихожан составляло 697 человек. На здании храма установлена памятная доска, посвящённая павшим в Освободительной войне, которая оставалась на своём месте и в советский период, когда приход возглавлял Иоанн Тамм, служивший здесь до 1953 года. Позже приход попал под попечительство священником из Хяэдемеэсте. В 2003 году в церкви был проведён широкомасштабный ремонт.