Изначально деревянная церковь на этом месте построена в 1718 году. В 1824 г. она сгорела. В 1825 начата и в 1829 г. закончена нынешняя. Последний настоятель до разрушения (известно лишь его имя - Пахомий) был арестован и увезён в неизвестном направлении в 1936 г.

С 1996 г. Началось создание общины, но официально Приход, как юридическое лицо зарегистрирован лишь в 2000 году. В том же году назначен Настоятель - иерей Александр Дягилев. Службы в полуразрушенной Преображенской церкви велись под временным навесом в алтарной части с 1998 по 2003 годы. Но в связи с тем, что стоять под разрушающимся куполом - риск для жизни прихожан, было принято решение богослужения в храме прекратить, решение его судьбы отодвинуть на неопределённый срок, а с 2004 года богослужения ведутся в приписной церкви св. вмч. и цел. Пантелеимона, расположенной рядом, на тот момент ещё строящейся, но уже пригодной для периодического совершения богослужений.

С 31 июля 2005 года богослужения там стали совершаться достаточно регулярно.

Село Загубье находится в 200 верстах от Петербурга, в 45 верстах от Новой Ладоги, на юго-восточном берегу губы Ладожского озера, так что по отношению к реке Свири, протекающей отсюда в 10 верстах, оно будет „за губой", почему и называется Загубье. Через село проходят: старый канал - времен Екатерины II и новый - Александра III, открытый в 1883 г.

В 1718 г., по отписке здешнего прихода от соседнего Пашского, была построена деревянная церковь и освящена 12 мая 1718 г. игуменом Стороженского монастыря Киприаном, по благословению Аарона, епископа Карельского и Ладожского. В 1824 г. она сгорела.

В 1825 г. заложена нынешняя каменная; она строилась на средства прихожан, с пособием в 3 000 руб. асс. от комиссии духовных училищ. 4 августа 1829 г. она освящена во имя Преображения Господня благочинным, протоиереем Никольского Сясьского погоста Иоанном Семеновым и местным священником Федором Иоанновым.

Длина церкви 12 саж., ширина 4.5 саж., высота колокольни с крестом 16 саж. В 1839 г. пристроен придел во имя св. Георгия. Причт состоит из священника и псаломщика. Священник получает 240 руб. жалованья, псаломщик - 70 руб. Священник живет в церковном доме, псаломщик в собственном. Церковного капитала 1 610 руб. На новом канале, у погоста, есть пароходная пристань.

Приход состоит из 4 деревень: Загубья, Мининой, Койвосари и Сторожно. В деревне Сторожно, на берегу Ладожского озера, есть церковь упраздненного монастыря, приписанная к Загубью в 1832 г., Сторожно от Загубья в 15 верстах. Всех прихожан муж. пола 341, жен. 413, крестьяне занимаются хлебопашеством и рыбной ловлей. По селам празднуют: Преображение (в Загубье и Минине), Димитрию Солунскому (в Минине), Параскеве, Николаю и Богоявлению (в дер. Сторожно), Арханг. Михаилу (в Койвосари).

Особенно уважаются иконы Тихвинской Божией Матери и Димитрия Солунского, находящиеся в деревянной часовне, в версте от церкви. Часовня построена на месте деревни, бывшей здесь до прорытия канала Екатерины II. В 8 верстах от села, на берегу Ладожского озера, есть другая деревянная часовня, с иконой св. Георгия, сюда бывает 23 апреля крестный ход для окропления скота святою водою. В Загубье есть земская школа, в которой учатся 24 мальчика и 11 девочек.

«Историко – статистические сведения о С.-Петербургской епархии». Выпуск 9, Санкт-Петербург, 1884 г. Типографии Департамента Уделов (Моховая ул., д. № 36). 

«…Нынешнее Загубье объединяет два старинных села Большое Загубье и Малое Загубье. Характер местности здесь тот же, что и в устье Паши, - низменная болотистая равнина. На фоне одноэтажной застройки Загубья сразу же привлекает к себе внимание высокий объем каменной церкви с колокольней. Построенная в 1829 году, Спасо-Преображенская церковь долгое время являлась приходской. Большой архитектурной ценности она не представляет, тем не менее осмотреть ее стоит хотя бы для того, чтобы в сравнении с ней полнее оценить своеобразие древней церкви в Сторожно. С колокольни Загубской церкви открывается панорама всего села с двумя параллельными друг другу старинными каналами…»

Источник: Андреева Л.А., Коляда М.И., Кондратьева Е.В. По Ленинградской области. - Лениздат. 1978 г.